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ncRNA研究的重要一步是发现与特定疾病相关的lncRNA。传统的lncRNA筛选方法（SELEX等）效率低下，假阳性率高。而基因芯片具有覆盖全面、高效、准确的特点

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连锁分析芯片是进行疾病连锁分析的最佳工具，目前有人类及小鼠共4款芯片可选择。

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了解编码药物代谢酶和药物转运蛋白的基因中的常见变异，能预测个体的遗传变异对代谢能力的影响，从而有可能大大有利于临床研究。

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Illumina定制芯片有两种：中高通量的iSelect定制芯片平台和中低通量的GoldenGate定制芯片平台。

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